SỞ KHOA HỌC VÀ CÔNG NGHỆ PHÚ YÊN được Sở kế hoạch và đầu tư cấp giấy chứng nhận đăng ký kinh doanh ngày 17-05-2005. Hiện tại công ty do ông/bà Nguyễn Văn Dũng làm đại diện pháp luật.